Đau bao tử thực ra chỉ là triệu chứng. Có rất nhiều nguyên nhân gây đau bao tử: lành tính như viêm dạ dày, loét dạ dày thực quản, chứng đầy hơi khó tiêu hoặc ác tính như ung thư dạ dày.... Vì vậy điều trị nó không có nguyên tắc chung mà còn tùy nguyên nhân, tiên lượng cũng vậy.